新設備安裝時主要污染源為兩大類：
一、焊接管路時的各種金屬碎屑、PVC碎屑等，若不處理，會對膜片造成不可逆的物理性劃傷。解決辦法：充分沖洗設備，確保將管路內的碎屑沖走。
二、水箱內的防腐涂料配比不均勻，造成有機物釋放，直接污染膜元件。解決辦法：水箱內容直接用 pH=2 的鹽酸浸泡 24 小時，浸泡后的水全部放掉不用。
舊設備膜更換時主要注意事項：
一、舊膜拆下后，需要認真清洗管路，可以用鐵絲綁一個拖把來擦凈膜殼內壁。防止管路中殘留雜質將新膜污染。
二、新膜安裝前，將保安過濾器內濾芯更換。以免被污染的濾芯進一步污染膜。
新RO膜安裝完成后，應該立即注滿干凈無氧化劑的水源，用2-4Bar低壓沖洗1小時，濃水和產水全部放掉，切勿直接進到二級RO入口或者回到一級RO入口，然后浸泡RO系統12小時以上，待充分潤濕后，啟動高壓泵產水（升壓速度 <0.7Bar/秒），但其產水和濃水在頭 24 小時內都應該全部放掉，切勿直接進到二級RO入口或者回到一級RO入口。若RO新膜頭24小時內的產水直接進到二級RO膜內，可能引起二級RO膜不可逆的通量損失。
對污水回用系統而言，為了避免污水中的未知有機污染物的潛在污堵，*好采用干凈的調試水源完成 RO 膜系統的調試，再按比例逐漸切換為 99%污水源。干凈的調試水源對污水回用系統來說是非常必要的減小初期污染的措施。
