隨著生物學的發展，原子探針顯微鏡得到了越來越多的應用和發展，如細胞動態觀察、樣品的三維成像等。那么，如何選購一臺原子探針顯微鏡呢？
選購步驟可從以下幾方面著手：
1.了解原子探針顯微鏡的基本原理
掃描隧道顯微鏡的原理
掃描隧道顯微鏡是根據量子力學中的隧道效應原理，通過探測固體表面原子中電子的隧道電流來分辨固體表面形貌的新型顯微裝置。
根據量子力學原理，由于電子的隧道效應，金屬中的電子并不局限于金屬表面之內，電子云密度并不是在表面邊界處突變為零。在金屬表面以外，電子云密度呈指數衰減，衰減長度約為1nm。用一個極細的、只有原子線度的金屬針尖作為探針，將它與被研究物質(稱為樣品)的表面作為兩個電極，當樣品表面與針尖非?？拷?距離＜1nm)時，兩者的電子云略有重疊，如圖1所示。若在兩極間加上電壓U，在電場作用下，電子就會穿過兩個電極之間的勢壘，通過電子云的狹窄通道流動，從一極流向另一極，形成隧道電流I。隧道電流I的大小與針尖和樣品間的距離s以及樣品表面平均勢壘的高度有關，其關系為，式中A為常量。如果s以10-1nm為單位，以eV為單位，則在真空條件下，A≈1，
由此可見，隧道電流I對針尖與樣品表面之間的距離s極為敏感，如果s減小0.1nm，隧道電流就會增加一個數量級。當針尖在樣品表面上方掃描時，即使其表面只有原子尺度的起伏，也將通過其隧道電流顯示出來。借助于電子儀器和計算機，在屏幕上即顯示出樣品的表面形貌。
原子力顯微鏡的基本工作原理
AFM系統主要由以下幾部分組成：(1)帶針尖的力敏感元件；(2)力敏感元件運動檢測裝置；(3)監控力敏感元件運動的反饋回路；(4)掃描系統(一般使用壓電陶瓷)，其作用是使樣品進行掃描運動；(5)圖象采集及顯示；(6)圖象處理系統。其中關鍵的是前兩部分。
AFM的工作原理如圖2所示。將一個對微弱力極敏感的微懸臂一端固定，另一端有一微小的針尖，針尖與樣品表面輕輕接觸。使針尖在樣品的表面上掃描，由于針尖原子與樣品表面原子間存在極微弱的排斥力(10-8-10-6N)，原子間作用力的檢測主要由光杠桿技術來實現。如果探針和樣品間有力的作用，懸臂將會彎曲。為檢測懸臂的微小彎曲量(位移)，采用激光照射懸臂的，四象限探測器就可檢測出懸臂的偏轉。如果控制這種力在掃描過程中保持恒定，則微懸臂將在垂直于樣品表面的方向上起伏運動，利用隧道電流檢測法或光學檢測方法，測定微懸臂對應于掃描各點的位置變化，從而可以獲得樣品表面形貌的信息。
根據AFM所測力的性質的不同，其工作模式及微懸臂運動的檢測方法將有所不同。所謂工作模式，主要是指AFM工作時微懸臂運動所處的狀態，主要可分為兩種。一種為準靜態工作模式，此時針尖與樣品的相互作用力較強，微懸臂有較大形變，可用隧道電流法，電容及激光束偏轉探測法等直接檢測此形變。處于該模式，針尖與樣品的間距小于0.03nm，基本上是緊密接觸的(故又稱接觸模式)。由于此時二者電子云發生重疊，導致儀器的分辨率，可達原子級水平。運用此種模式可測量原子間的相互作用力，所測最小力可達10-9N。對于針尖與樣品間的摩擦力，也可用該模式進行測量，這時最小檢測極限可達10-10N。根據反饋方式的不同，該模式又可分成恒力模式和形變變化模式兩種。前者反饋信號控制樣品上下運動，使得微懸臂的形變及其與樣品間的相互作用力保持恒定；后者樣品只進行掃描運動，反饋線路控制使得微懸臂隨表面的起伏而上下運動。此時，由于反饋直接控制隧道針尖，導致儀器工作穩定，但其數據的解釋要困難一些。
上面描述的這種接觸模式適應于對硬表面的觀察，并可達到較高的分辨率，但這種接觸模式與樣品表面相互作用較強，對于生物樣品，由于它相對于云母，石墨及金等固體材料具有較大的柔軟性，目前對其觀察還沒有達到足夠高的分辨率，在針尖掃描時，有時還會造成樣品表面的損傷。而對于吸附在堅硬表面的樣品，在探針的作用下有時會被移動而不利于成像。對于生物材料，由于其表面較軟如果采用接觸模式，在不降低其分辨率的情況下，應盡量降低針尖與樣品的作用力，以免造成表面損傷。
