復式顯微鏡是由二個或二組透鏡和復式顯微鏡機械本體組成，是一般實驗室內供人觀察生物標本所用的儀器，也是我們印象中的顯微鏡。此種顯微鏡的二組透鏡，一組是接近觀察之標本的透鏡稱為接物鏡或簡稱為物鏡，另一組是靠近眼睛，用觀察的透鏡，稱為接目鏡或簡稱目鏡。復式顯微鏡因功用和使用目的之不同，又可分為立體(解剖)顯微鏡和普通光學顯微鏡。
a、普通(或一般)光學顯微鏡
普通光學顯微鏡是一般人卯象中的顯微鏡，主要是用來觀察透或近乎透明的材料(物體或生物標本)。此種顯微鏡觀察用的材料，除較簡單的低等生物(如細菌、真菌和大部分藻類等等)外，大都需用經過事先的處理和切成薄片，制作成臨時或切片后，才可以在顯微鏡下觀察。普通光學顯微鏡使用的光源可穿透標本，故常用于觀察生物體的器官組織結構或生物細胞的內部構造。
b、立體(解剖)顯微鏡
立體顯微鏡主要是用來觀察不透明的物體或生物標本之外部形態，抑或運用在工業線和部分生物醫學技術上。此種顯微鏡因受光源、景深和其它成像因子的影響，放大倍率在60倍以下，解像效果較佳。
